Родился 1 марта 1956 г. в Перми в семье нефтяников. После окончания средней школы в 1973 г. поступил в Пермский политехнический институт, который закончил в 1978 г., получив специальность горного инженера. Во время учебы при прохождении производственной практики работал в НГДУ "Полазнанефть", "Коминефть" помощником бурильщика, оператором по добыче нефти и газа.

С 1978 г. – инженер, младший научный сотрудник ПермНИПИнефти.

С 1981 по 1988 г. работал в Пермском городском, областном комитете комсомола, областном спорткомитете.

В 1988 г. создал и возглавил физкультурно-оздоровительное объединение "Контакт".

С 1990 г. – генеральный директор предприятия "ЭКС ЛИМИТЕД", с 1996 г. – президент АО "Э.К.С. Интернешнл", объединившего предприятия группы "ЭКС".

С 1994 г. – председатель Комитета по экономической политике и налогам областного Законодательного собрания и депутат Пермской городской Думы.

В декабре 1996 г. в первом же туре одержал победу на выборах Главы города Пермь. За Ю.П.Трутнева проголосовало 61,42 % пермяков, пришедших на выборы.

С 9 декабря 1996 г. – Глава города Пермь.

В 1998 г. награжден орденом Почета.

В декабре 2000 г. в первом туре одержал победу на выборах губернатора Пермской области. За Ю.П.Трутнева проголосовало 51,48 % жителей Прикамья, пришедших на выборы.

9 марта 2004 г. Указом Президента РФ № 325 назначен Министром природных ресурсов Российской Федерации.

Женат, воспитывает двух сыновей.

Среди главных увлечений – спорт (Ю.П.Трутнев является обладателем 5-го дана каратэ кекушинкай), автогонки, охота.